Eğitim Modeli ve Katılım Seçenekleri
Programımız iki farklı grup halinde yürütülmektedir:
Eğitim saatleri: 10:00 - 17:30 (Toplam 22,5 saat)
Etkinlikten önce. Atölyeden üç hafta önce, bu eğitime özel hazırlanmış uygulamalı videolardan ve bir hazırlık kitapçığından oluşan bir ön hazırlık modülü katılımcılarımızla paylaşılacaktır. Bu modül, programın ilk günü işlenecek terminal ve R temellerine hazırlık niteliğinde olup tüm eğitimin temelini oluşturmaktadır.
Etkinlik boyunca. Her katılımcı, kendisine ayrılmış izole bir bulut ortamında çalışacaktır.
1. ve 2. gün. Herkesin baştan sona, uygulamalı olarak kod yazdığı çalışmalarla tamamlanacaktır.
3. gün. Bu gün proje bitirme çalışmasına ayrılmıştır.
Üzerinde çalışacağınız pipeline'lar
• Bulk RNA-seq (1. gün): Veri yapısını anlamak üzere keşif analizleri, DESeq2 ile analiz, akademik kalitede figürler.
• Single Cell RNA-seq (2. gün): Seurat ile QC, clustering ve hücre tipi anotasyonu.
• DNA varyant analizi (2. gün): FASTQ'tan VCF'e geçiş, variant calling, kalite ölçütleri.
• Yeniden üretilebilirlik (3. gün): Çalışmaları sabit sürümlerle arşive dönüştürme ve Zenodo ile kalıcılaştırma.
• Bitirme projesi (3. gün): Kod desteği olmadan, yeni bir veri setiyle analizi baştan sona kurma ve GitHub üzerinden değerlendirme.
Katılım belgesi. Bitirme projesini tamamlayanlara verilen; GitHub Pages üzerinden doğrulanabilir, doğrudan sizin proje reponuza bağlı, CV/LinkedIn uyumlu dijital sertifika.
